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GraphPad Prism繪制熱圖

發(fā)布日期:2025-01-20     點擊數(shù):

一、案例數(shù)據(jù)

熱圖(Heatmaps)是將數(shù)據(jù)矩陣中的各個值按一定規(guī)律映射為顏色來進行展示,利用顏色變化實現(xiàn)數(shù)據(jù)的可視化。通過熱圖,我們可以快速地了解數(shù)據(jù)的分布規(guī)律、熱點區(qū)域以及密度變化情況,為圖像分析提供直觀的參考依據(jù)。根據(jù)下列范例數(shù)據(jù)(范例數(shù)據(jù)為隨機數(shù)據(jù),無生物學意義),利用GraphPad Prism軟件繪制熱圖。

二、軟件操作方法

1、圖表選項

1.1 打開Graphpad Prism軟件,圖表類型選擇“Grouped”;

1.2 勾選“Enterorimport data into a new table”;

1.3 Options選擇“Enter and plot a single Y value for each point”;

1.4 點擊“Creat”創(chuàng)建新圖表。(圖1)

圖1 創(chuàng)建圖表

2、寫入/導入數(shù)據(jù)(圖2)。

圖2 數(shù)據(jù)錄入

3、在左側項目列表中Graphs處選擇Date 1,圖表類型選擇“Heat Map”,并在其中選擇一種配色方案,即可初步得到繪制的熱圖。(圖3)

圖3 生成曲線圖形

4、圖形調(diào)整與優(yōu)化:

4.1 顏色設置:雙擊繪圖區(qū)域,打開Format Graph窗口,在Color mapping選項卡下,修改Colormap為“Doublegradient”,在Range選項下可修改顏色范圍,也可自定義最小值和最大值。(圖4-1)

圖4-1 熱圖顏色修改

4.2 坐標設置:在Format Graph窗口中點擊“Labels”,“Row Labels”中修改橫坐標標簽信息,Mark選項選擇“Every”,可以在“Font”中修改字體;“Column Labels”修改如同“Row Labels”。修改后點擊“Apply”。(圖4-2)

圖4-2 橫縱坐標標簽信息修改

4.3 熱圖邊框修改:切換至Graph Settings選項卡,修改Heatmap borders的粗細為“1 pt”,即熱圖邊框的粗細,也可修改顏色。勾選“Cell borders”可顯示每個單元格的邊框,如圖4-3。

圖4-3 熱圖邊框修改

4.4 顯示坐標標題:切換至“Titles”選項卡,勾選“Show row labels title”和“Show column labels title”即可。(圖4-4)

圖4-4 熱圖坐標標題修改

5 若需要對熱圖添加間隙,可打開Format Graph窗口,點擊Gaps選項,對“Vertical gaps”和“Horizontal gaps”進行編輯,比如我們需要橫向和縱向都進行分組,可以如圖5進行設置。

圖5 熱圖添加間隙設置

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